Hallo Ole,
Es gibt Keramikstifte, mit denen man z.B. Tassen bemalen kann und dann im Backofen "brennt" um das Ganze zu fixieren. Da man die Tassen dann auch ohne Probleme im Geschirrspüler waschen kann ohne dass da was abgeht würde ich vermuten, dass im Aquarium auch keine Giftstoffe abgegeben werden. Allerdings kann ich nicht sagen, ob die auch für Tontöpfe geeignet sind... müsstest du mal recherchieren oder ausprobieren.
Bei allen anderen wasserfesten Markern für Folien oder sowas würde ich denken, dass da doch was ins Wasser abgegeben wird.